Отделението по ендокринология и болести на обмяната е единственото специализирано отделение по ендокринология в област Пазарджик.

В отделението се работи по всички ендокринни пътеки в съответствие със стандарта по ендокринология – трето ниво на компетентност – диагностика и лечение на остри, обострени и хронични заболявания на ендокринната система с усложнено протичане, като се прилагат съвременни диагностични методи и терапевтични схеми и се провежда обучение на пациентите.

Основната дейност на отделението по ендокринология и болести на обмяната включва прием за диагностика и лечение на пациенти със захарен диабет, заболявания на щитовидната жлеза, паращитовидните жлези, хипофизата, наддбъбречните жлези, половите жлези, костни метаболитни заболявания, нарушения на калциево-фосфорната обмяна, метаболитни нарушения.