Операционный блок отвечает стандартом третьего уровня - высший уровень компетентности.

Организация и расположение операционного блога соответствует медицинскими стандартами хирургии, нейрохирургии, торакальной хирургии, сосудистой хирургии, детской хирургии, пластической, реконструктивной и эстетической хирургии, урологии, акушерства и гинекологии.
Блок оснащен 6 высокотехнологичными залами, один из которых представляет собой гибридную операционную, что позволяет работать на высшем уровне, как однопрофильным, так и многопрофильным командам в области сосудистой хирургии, нейрохирургии и, при необходимости, совместно с другими хирургическими специальностями.

В операционном блоке могут быть выполнены самые большие по объему и сложности хирургические вмешательства благодаря тому, что помимо гибридной операционной, все остальные залы оснащены лапароскопическим оборудованием, двумя нейрохирургическими микроскопами высшего класса, рентгеновским оборудованием (C-дуга и Кугель), эндоскопическим оборудованием для верхней и нижней эндоскопии, цистоскопии и гистероскопии, ультразвуковым оборудованием для интраоперационного УЗИ, современной информационной системой для мониторинга показателей жизненно важных функций до и во время операции и прямая связь со структурами лучевой диагностики и клинической лаборатории, микробиологии и всеми остальными структурами медицинского учреждения. Операционные располагают также вакуумным отделением, соединяющим каждый зал с остальной частью больничного комплекса и позволяющее быстро отправлять биологические материалы как в патологоанатомическую лабораторию, так и в другие лаборатории.

В операционном блоке также есть залы для перевозки пациентов и зал для до- и послеанестезиологической обработки, а также комнаты для эндоскопических исследований.
В отделении работает бригада операционных медсестер и операционных акушерок, компетентных в каждой хирургической дисциплине.